退役后从执教小俱乐部开始了他的教练生涯，德乙联赛的福尔图娜科隆是舒斯特尔执教的第一支球队，虽后又执教了当时仍在德乙的同城球队科隆，但是由于未能将球队带入德甲而离职。

2001年他接受了西班牙足球乙级联赛一支中游球队赫雷斯的主教练合约，在球队执教的两年里取得了非常成功的成绩，这两个赛季是该俱乐部历史上战绩最佳的两个赛季，但是他无法将这样的俱乐部进一步的带入西甲。

无法在西班牙更好的俱乐部得到合约后，他选择了执教乌克兰足球超级联赛的豪门球队顿涅茨克矿工，他率领球队取得了多场的连胜，但是到了最后关头，俱乐部却未能取得令人兴奋的成绩。尤其在冠军联赛中，球队在一场混战中输给了莫斯科火车头未能进入赛事的分组赛，也未能取得联赛冠军。舒斯特尔在2004年球队夺得乌克兰杯前一周被俱乐部解雇。

他在2004年夏天返回西班牙执教莱万特，这支巴伦西亚的小俱乐部在取得了良好的联赛开局后到了联赛收关阶段逐渐疲软，在联赛还剩五轮俱乐部离保级区只有5分优势的时候，舒斯特尔遭到了俱乐部的解职，莱万特随后也未能取得一场联赛胜利，而再次降入西乙。

在2005年夏天，成为了赫塔费的主教练，舒斯特尔在这支小俱乐部的执教十分成功，赫塔费取得了西甲联赛的第七名并且获得了参加2007-08赛季欧洲联盟杯的参赛资格，更令人不可思议的是在西班牙国王杯半决赛中赛前完全不被人看好的赫塔费在首回合2-5惨败给联赛豪门巴塞罗那后，第二回合奇迹般的4-0痛击巴萨晋级决赛。[3]最终在决赛中0-1惜败于塞维利亚。

舒斯特尔在2007年7月9日正式取代被俱乐部解雇的卡佩罗，成为皇家马德里的新任主教练。[4]一上任舒斯特尔改前了前任教练卡佩罗保守之战术，由季初到季末一直排在联赛榜首的位置，并以85分高联赛积分赢得西甲冠军。

然而，第二季的皇马却在联赛接连失利，开始有人对舒斯特尔心存怨言。在2008年12月9日，舒斯特尔正式被皇家马德里解雇，事原他在对战死敌巴塞罗那之前表示“皇家马德里以当时的状态不可能战胜巴塞罗那”，让皇家马德里的高层不满。

继2014年结束马拉加俱乐部执教之后，2018年3月19日晚间，中超联赛大连一方足球俱乐部官方突然宣布舒斯特尔接替执教不满三个月的马林成为俱乐部新任主教练。成为当时大连足球俱乐部历史上名气最大的主教练。

2018年11月11日，舒斯特尔率领大连一方队2：0战胜长春亚泰队，最后一轮惊险保级。